Proces terapii składa się z etapów, podczas których są realizowane sesje treningu słuchowego, które mają miejsce codziennie.
Przed każdym etapem ma miejsce diagnoza uwagi słuchowej w celu oceny postępów i stworzenia indywidualnego programu treningu.
W klasycznym, opracowanym przez Tomatisa podejściu, pierwszy etap terapii trwa 15 dni i każdego dnia pacjent słucha filtrowanej muzyki przez co najmniej 2 godziny.
Kolejny etap ma miejsce po 4-6 tygodniach przerwy, następne przeciętnie co dwa miesiące.
Aktualnie stosowane są również modyfikacje czasu trwania poszczególnych etapów.